Introducción: La candidiasis invasiva, necesita del diagnóstico  oportuno y elevada sospecha clínica, teniendo en consideración  el cuadro clínico y la presencia de factores de riesgo. Objetivos: caracterizar  aspectos microbiológicos y epidemiológicos en aislamientos del género Candida en niños hospitalizados en servicios de atención al grave, de centros hospitalarios de la ciudad  de Santa Clara,  provincia Villa Clara, durante los años 2010 al 2012. Método: Se realizó un estudio transversal descriptivo, la población del estudio estuvo constituida por un total de 71 aislamientos  obtenidos  del hemocultivo y cultivo del catéter. Con los datos obtenidos se calcularon frecuencias absolutas y relativas, los resultados se distribuyeron en tablas. Resultados: Se observó un incremento en los aislamientos de especies del género Candida provenientes en mayoría del hemocultivo 95,8 %,  en el 100% de los casos los pacientes susceptibles estuvieron sometidos al uso de antimicrobianos de amplio espectro. Candida tropicalis  constituyó el 33,8% de los aislamientos, las cepas de mayor resistencia a fluconazol las aportó Candida krusei  con un 100%  y Candida albicans con 37,5%. Conclusiones: La especie de mayor incidencia fue Candida tropicalis. El sexo femenino fue el más afectado y  el  mayor número de aislamientos según la edad fue en el lactante. La institución más afectada, fue el Hospital Pediátrico Docente José Luis Miranda y la terapia intensiva el servicio de mayor incidencia. El uso de antimicrobianos de amplio espectro estuvo presente en la totalidad de los aislamientos,  la especie de mayor resistencia a  fluconazol fue Candida krusei.